2014年10月19日

整个外显子组测序接近成为“新家族史”

来自贝勒医学院的贝勒医学院的研究人员说,将3,386例DNA提交临床全外显子组检测的患者中,约有四分之一被诊断出与一种已知的遗传病有关,通常会结束对其及其父母的长期寻找答案。分子和人类遗传学与儿科以及贝勒人类基因组测序中心和德克萨斯大学休斯敦健康科学中心。

在在线报告中 美国医学会杂志博士领导的科学家。贝勒全基因组实验室的实验室主任杨亚平和分子与生物学教授Christine Eng 贝勒(Baylor)和贝勒医学遗传学实验室(Bayes's Medical 遗传学 Laboratories)的高级主管发现分子诊断(即与 )在25%的大型病例组中–证实了这一更大的患者组中出现的头250例病例的初步报告的诊断率 新英格兰医学杂志 比一年前多一点。

贝勒大学分子与人类遗传学和儿科学教授,该报告的合著者詹姆斯·鲁普斯基博士说:“我相信,这份报告中的发现将永远改变整个儿科和医学的未来实践。” “基因组学在医师的工作清单中上移并在进行鉴别诊断之前下令只是一个时间问题。这将是新的'家族史',更好的是,这使您同时继承了两个重要的变异体来自每个父母的身分以及导致疾病易感性的新突变。”

实际上,做出的诊断中有很大一部分是患者,他们遗传了一个新的突变(在卵子或精子中),而这种突变是他们父母以前没有的。

贝勒医学院人类基因组测序中心主任,报告的作者理查德·吉布斯博士说:“新基因组方法在临床上的常规应用不仅使患者受益,而且改变了我们对研究的看法。”

分子与人类遗传学教授Arthur Beaudet博士说:“很高兴看到这个庞大的团队从诊所的患者过渡到最前沿的基因组技术,为家庭提供以前没有的答案。”他是全基因实验室成立时的系主任,也是贝勒医学院医学遗传学实验室的创办人。

恩格说:“对于2012年6月至2014年8月之间进行了完整外显子组测序的整套未诊断的3386名患者,诊断率保持不变。”恩格说,他对2,000名连续患者进行了详细分析。

该程序涉及使用称为下一代测序的新测序技术对患者的DNA进行测序,并将这些结果与正常参考进行比较。然后,还将与疾病相关的任何突变与父母的DNA进行比较,以确定孩子是从一个父母还是两个父母那里遗传下来的,以便更好地了解疾病的原因。在这项研究中,整个外显子组测序还确定了医生可以进行临床干预的方式,以改善或消除不良症状,并为家庭提供有关可能疾病进程的更多信息。

这项研究的第一作者杨说,除了证实大批患者中25%的诊断率外,最新研究还表明罕见的遗传事件对疾病的易感性起很大的作用。 贾玛 研究。

导致疾病的主要因素是从头事件,在这种情况下,患者的单亲二体性(一个人继承了两个拷贝的她说,这是同一个父母的变异),马赛克和副本编号。

德州儿童医院的儿科遗传学家Lupski说:“临床外显子组测序可以帮助诊断各种疾病,这是诊断上的两难选择。”该研究中的许多患者都是从美国德克萨斯州儿童医院或其他医疗中心转诊的。

“罕见变异和孟德尔病是造成疾病人群的重要因素。这与研究(通过全基因组关联研究)遗传变异如何导致疾病易感性的遗传学家的思想形成了鲜明的对比。我们发现“罕见变异”实际上在总体上Lupski说:“个别疾病可能很少见,但成千上万的此类疾病,而更多的是通过基因组学定义的。”

“我希望在几年内,我们将了解整个外显子组测序在成人医学和发展之外的儿科领域中的重要性,”贝勒的儿科以及分子和人类遗传学教授莎伦·波隆博士说。以及贝勒癌症遗传学诊所的主任和德克萨斯儿童癌症中心的成员。 “我们目前正在儿童癌症患者中进行一项由NIH支持的全外显子组测序临床试验,以了解其对这些患者的潜在用途。”

在对2,000例患者的详细研究中,对504例患者进行了分子诊断,其中280例患者具有导致疾病的单基因突变(常染色体显性),181例常染色体隐性遗传(两个突变基因),65例X连锁(突变)。 X染色体),推测其中一个是通过线粒体遗传的。在五例中,患者从同一个父母那里继承了两个副本的突变基因(单亲二体)。在主要突变中,有208个是不从任何一个亲本继承而来的从头突变,有32个被继承,有40个没有确定,因为亲本样本无法用于实验室分析。

在从头突变中,有五个表现出镶嵌性,这表明该突变是在受精后发生的。镶嵌术意味着患者体内的细胞群体与人类体内大多数细胞的遗传模式不同。

研究人员在504个病例中发现了708个推定的致病性等位基因,其中大多数是新颖的,以前没有报道。值得注意的是,近30%的诊断发生在仅由研究人员在最近三年中发现的疾病基因中。在65例患者中,除了外显子组测序外,没有其他可用的基因检测方法,可以在订购检测时找到突变的基因。

23名患者(约5%)在两个不同的基因中发生了突变,这可能解释了患者医疗状况的各个方面。

英格说:“医生通常试图找到一种能够解释患者可能遇到的所有问题的诊断。我们发现,在某些情况下,患者可能具有两种不同状况的混合表型。” “患者可能有两种不同的罕见遗传病来解释他们的病情,这是在使用整体疗法之前的意外发现。 。”

在这2,000例病例中,有92例患者偶然发现了可用于医疗的结果,可能导致早期诊断,筛查或治疗。三名患者有一个以上的发现。

“对于25%的案件, ,这些信息结束了诊断性征兆,提供了更全面的医疗管理,并能够准确确定生殖风险,但在相对少数情况下,需要采取特殊的治疗措施来扭转这种状况。”



Provided 通过 贝勒医学院
引文: 整个外显子组测序接近成为“新家族史”(2014年10月19日) 2020年11月6日检索 from //xasqxhb.com/news/2014-10-exome-sequencing-closer-family-history.html
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