2019年11月20日

研究人员开发了可药物融合靶标的新数据库

信用:CC0公共领域

当来自两个独立基因的片段由于各种因素(例如易位或剪接)而合并时,形成的杂交体称为基因融合体。近年来,已经发现这些融合事件在癌症和其他复杂疾病的发展中起着至关重要的作用。但是,很少有资源可以整理所有这些信息并在一处使用。通过从公开数据中分析超过一百万个核酸序列,由Bar-Ilan大学Azrieli医学学院的Milana Frenkel-Morgenstern博士领导的研究小组确定了111582个融合体,涉及八种物种(人,小鼠,大鼠,果蝇,野猪,斑马鱼,酵母和牛)。

该数据库的最新和最新版本称为ChiTaRS,刚刚在科学期刊上发布 核酸研究。该数据库目前由萨法德市阿兹列里医学院的癌症基因组学和复杂疾病生物计算实验室维护,对于专门研究复杂疾病(尤其是癌症,阿尔茨海默氏病)的临床医生将非常有用 ,精神分裂症等。

此版本的ChiTaRS收集可药物治疗的融合靶标案例。近年来,这些融合基因中的许多已作为特定靶标,特别是对于化学治疗药物。一些众所周知的例子包括BCR-ABL1 非小细胞肺癌中慢性粒细胞白血病(CML)和EML4-ALK嵌合体的表达 (NSCLC)。 ChiTaRS 5.0提供了800多种药物融合的清单,将近120种药物或药物组合用作目标,可用于复杂疾病的个性化治疗。

该资源将有助于研究人员确定嵌合体/融合物在致癌作用中的功能。在3-D染色质图谱和进化生物学等领域,这也将是有利的。这是Frenkel-Morgenstern教授的研究小组的最新资源,该小组已经维护了 就像用于融合文本挖掘(ProtFus)和融合蛋白与蛋白质相互作用(ChiPPI)的服务器。

更多信息: Deepak Balamurali等人,ChiTaRS 5.0:与可药用融合物和3D染色质图谱相匹配的嵌合转录本的综合数据库, 核酸研究 (2019)。 DOI:10.1093 / nar / gkz1025

期刊信息: 核酸研究

由...提供 巴伊兰大学

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