2020年5月5日

基于SHERLOCK的一步测试可提供快速,灵敏的COVID-19检测

新的基于CRISPR的研究工具可在一个小时的一步反应中提供结果;研究人员共享方案和试剂盒,以推进研究并朝着临床验证的方向发展。

麻省理工学院麦戈文脑科学研究所,麻省理工学院和哈佛大学,拉贡研究所和霍华德·休斯医学研究所(HHMI)的一组研究人员 新的诊断平台 称为STOP(在一锅中进行SHERLOCK测试)COVID。该测试可在一个小时内作为一步反应进行,且操作最少,可推进基于CRISPR的研究 SHERLOCK诊断技术 更接近现场护理或家庭测试工具。该测试未经FDA审查或批准,目前仅用于研究目的。

在得知一种新病毒的出现后,研究小组于1月份开始开发针对COVID-19的测试,该病毒对中国的医疗系统构成了挑战。的 第一版 该团队基于SHERLOCK的COVID-19诊断系统已经在泰国的医院中用于帮助筛查患者的COVID-19感染。

新测试名为“ STOPCovid”,并且基于STOP平台。在研究中,它已显示出能够通过简单的方法快速,准确且高度灵敏地检测COVID-19病毒SARS-CoV-2,该方法只需进行最少的培训,并使用简单易用的设备(例如试管和水)浴室。 STOPCovid已使用来自诊断为COVID-19的患者的鼻咽拭子在研究环境中进行了验证。它也已经在唾液样品中成功测试过,唾液样品中已添加SARS-CoV-2 RNA作为原理证明。

该小组今天将在新网站上发布开放协议, 停止。它正在根据 COVID-19技术访问框架 由哈佛大学,麻省理工学院和斯坦福大学组织。该框架设置了一个模型,通过该模型,可以帮助您预防,诊断或治疗COVID-19感染的至关重要的技术而毫不拖延地实现最大的公共利益。

迫切需要进行广泛,准确的COVID-19测试,以快速检测出新病例,理想情况下不需要专用实验室设备。这样的测试将能够及早发现新的感染并推动有效的“测试-跟踪-隔离”措施来迅速遏制新的爆发。但是,当前的测试能力受到复杂程序和实验室仪器的要求以及对有限供应的依赖的限制。 STOPCovid可以在不提取RNA的情况下进行,尽管所有患者测试均使用鼻咽拭子的样本进行,但初步实验表明最终不一定需要拭子。消除这些障碍可以帮助实现广泛的分布。

“在家中,甚至在药房或工作场所测试COVID-19的能力,可能会改变游戏规则,使人们安全地回到工作场所和社区,”张章说。 CRISPR基因组编辑技术,麦戈文脑科学研究所和HHMI的研究人员,布罗德研究所的核心研究所成员。 “创建即时医疗工具是至关重要的目标,可以及时做出决定,以保护患者及其周围的人。”

为了满足这一需求,Zhang,McGovern研究员Omar Abudayyeh和Jonathan Gootenberg及其同事发起了开发STOPCovid的努力。他们正在共享他们的发现和包装试剂,以便其他研究团队可以迅速跟进其他测试或开发。该小组还通过StopCOVID.science网站和已提交的预印本共享数据。该网站还是一个枢纽,公众可以在其中找到有关团队发展的最新信息。

STOPCovid尚未获得FDA批准,目前正用于研究目的。

这个怎么运作

STOPCovid测试将CRISPR酶与互补扩增试剂结合在一起,该CRISPR酶经过编程可识别SARS-CoV-2病毒的特征。这种组合可以检测出样本中少至100份SARS-CoV-2病毒。因此,STOPCovid测试可对COVID-19进行快速,准确和高度灵敏的检测,该检测可在临床实验室设置之外进行。

STOPCovid已在患者鼻咽拭子上进行了临床验证测试,同时进行了测试。在这些面对面的比较中,STOPCovid以97%的敏感性和100%的特异性检测出感染。在没有任何昂贵或专业化实验室设备的情况下,结果显示在类似于妊娠试验的易于阅读的试纸上。此外,研究人员将模拟SARS-CoV-2基因组掺入健康 并显示STOPCovid能够从唾液中进行灵敏检测,从而消除了对棉签供不应求的需求,并有可能使采样更加容易。

奥马尔说:“该测试的目的是最终使之足够简单,以至于任何人都可以在资源匮乏的环境中使用它,包括在诊所,药房或工作场所,甚至有可能将其变成交钥匙形式以供家庭使用。”麻省理工学院麦戈文脑科学研究所研究员麦格文·阿布迪耶(Abudayyeh)

McGovern研究员Jonathan Gootenberg补充说:“由于STOPCovid可以在不到一个小时的时间内运行,并且不需要任何专用设备,而且如果我们在唾液中测试合成病毒的初步结果能够在患者样本中得到证实,那么它可以满足对可扩展测试的需求。重新开放我们的社会。”

重要的是,完整的测试-病毒基因组扩增和随后的检测-可以在单个反应中完成,如网站上所述,可以从拭子或唾液中获得。为了对此进行工程设计,该团队测试了多种CRISPR酶,以找到一种在执行扩增的酶所需的相同温度下能很好发挥作用的酶。 Zhang,Abudayyeh,Gootenberg及其团队,包括研究生Julia Juung和Alim Ladha,定居于一种名为AapCas12b的蛋白质上,该蛋白质来自嗜酸菌Alicyclobacillus嗜酸菌,它负责与变质的橙汁相关的“变味”。利用AapCas12b,该团队能够开发一种可以在恒定温度下执行的测试,并且不需要在过程中途打开管子,这一步骤通常会导致污染和不可靠的测试结果。

信息共享和下一步

该团队已为10,000个测试准备了试剂,以与世界各地免费的想要评估STOPCovid的科学家和临床合作者共享 进行潜在的诊断用途,他们已经建立了网站 停止 与科学和临床社区共享最新数据和更新。

要了解有关STOPCovid技术和即时核酸检测的更多信息,请访问 停止。也可以通过网站上的表格索取试剂盒和试剂。



引文: 基于SHERLOCK的一步式测试提供了快速灵敏的COVID-19检测(2020年5月5日) 2020年11月18日检索 from //xasqxhb.com/news/2020-05-sherlock-based-one-step-rapid-sensitive-covid-.html
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