2020年10月29日

新型SARS-CoV-2变种将于2020年夏季在欧洲传播

新型SARS-CoV-2变体将于2020年夏季在欧洲传播。图片来源:巴塞尔大学

根据本周发布的未经同行评审的预印本,来自巴塞尔和西班牙的研究人员已经确定了一种新的SARS-CoV-2变种,该变种最近几个月在欧洲广泛传播。尽管没有证据表明这种变体更危险,但其传播可能使人们深入了解欧洲国家在夏季采取的旅行政策的有效性。

仅在欧洲,新的数百种不同的变体 SARS-CoV-2目前正在传播中,其基因组发生突变。但是,这些变体中只有极少数能像新发现的名为20A.EU1的变体一样成功传播并流行。

巴塞尔大学苏黎世联邦大学苏黎世分校和SeqCOVID-西班牙财团的研究人员分析并比较了从整个欧洲的COVID-19患者收集的病毒基因组序列,以追踪病原体的进化和传播(见方框)。他们的分析表明,该变体于夏季起源于西班牙。这种新变种的最早证据与西班牙东北部农业工人中的超级传播事件有关。该变种进入当地人口,在全国范围内迅速扩张,现在占西班牙序列的近80%。

该研究的主要作者,巴塞尔大学的艾玛·霍德克罗夫特博士强调:“重要的是要指出,目前尚无证据表明新变异的传播是由于突变增加了传播或影响了临床结果。”研究人员认为,夏季放宽旅行限制和社会疏远措施有助于该变种的扩展。

与西班牙春季相似的模式

SeqCOVID-西班牙财团的负责人,论文的合著者伊纳基·科马斯(IñakiComas)教授建议:“我们在西班牙看到的这种变体的模式与春季相同。” “借助最初的超级传播事件,一种变体可以迅速在全国范围内普及。”

从7月起,随着欧洲边界的开放,20A.EU1与旅行者一起移动,现已在十二个欧洲国家中被发现。它也已从欧洲传播到香港和新西兰。虽然该变体最初可能是直接从西班牙引入的,但该变体随后可能继续从次级国家传播开来。

当前,20A.EU1占英国序列的90%,爱尔兰序列的60%,瑞士和荷兰序列的30-40%。这使得该变体目前成为欧洲最流行的变体之一。在法国,比利时,德国,意大利,拉脱维亚,挪威和瑞典也已发现它。

旅行促进了传播

遗传分析表明,该变体在欧洲国家之间传播了至少数十次,甚至可能数百次。该研究的主要研究者之一苏黎世联邦理工学院(ETHZürich)的坦贾·斯塔德勒(Tanja Stadler)教授说:“我们可以看到该病毒已在多个国家多次被引入,并且其中许多已在整个人群中传播。”一个介绍的情况恰好做得很好。”

尽管20A.EU1的患病率上升与今年秋天在许多欧洲国家观察到的病例数增加相对应,但该研究的作者告诫不要将新变种解释为病例数上升的原因。该研究的主要研究者之一的巴塞尔大学的理查德·尼赫尔教授说:“这不是近几周和几个月来唯一出现的变种。” “的确,在一些COVID-19病例显着增加的国家,例如比利时和法国,其他变体很普遍。”

对西班牙夏季SARS-CoV-2流行率的分析和旅行数据表明,这些因素可以解释20A.EU1如何如此成功地传播。西班牙的病例数量相对较高,并且作为度假胜地而受到欢迎,这可能给引入机会提供了多种机会,其中一些机会可能在返回家乡后因危险行为而爆发。

该研究的作者强调了评估边境管制和旅行限制如何有效遏制夏季SARS-CoV-2传播的重要性,以及旅行的作用。 “长期边界关闭和严重 Hodcroft解释说,“这是不可行或不理想的,但从20A.EU1的普及来看,似乎很明显,所采取的措施通常不足以阻止今年夏天引入的变体继续传播。当各国努力使SARS-CoV-2病例下降到低水平时,确定更好的“开放”方式而又不冒增加病例的风险至关重要。

评估新变体的表型

新变种首先由Hodcroft在使用“ Nextstrain”平台对瑞士序列进行分析的过程中发现,该平台由巴塞尔大学和华盛顿西雅图的弗雷德·哈钦森癌症研究中心共同开发。 20A.EU1的特征是突变,该突变修饰了病毒的刺突蛋白,核衣壳和ORF14蛋白中的氨基酸。

尽管目前的知识水平并未表明20A.EU1的传播是由于传播能力的变化所致,但作者目前正在与病毒学实验室合作,研究称为S:A222V的刺突突变可能对SARS产生的任何潜在影响。 CoV-2病毒的表型。他们还希望尽快获得访问数据的机会,以使他们能够评估该变体的任何临床意义。

此外,该研究的作者还强调了密切监视新变种(如20A.EU1)的重要性:“只有通过对病毒基因组进行测序,我们才能鉴定出新的SARS-CoV-2变种,并监测它们在病毒中的扩散Neher补充说,“但是国家之间的序列数量差异很大,通过欧洲范围内更快,更常规的测序工作,我们也许能够更快地识别出上升的变异体。”

更多信息: Emma B Hodcroft等。 2020年夏季,SARS-CoV-2变体在欧洲出现并传播, (2020)。 DOI:10.1101 / 2020.10.25.20219063

由...提供 巴塞尔大学

加载评论 (0)