2021年1月12日

使用基因组流行病学精确追踪英国的COVID-19传播链

由牛津大学和爱丁堡大学的研究人员领导的一组科学家分析了英国第一波COVID-19疫情,并进行了迄今为止规模最大,最全面的基因组分析。

Their analysis draws on >50k virus genome sequences—26k of which were gathered through the COVID-19 Genomics UK (COG-UK) consortium—offering a never-before-seen level of insight into the 要么igins 和 behaviour of 传播 chains since the start of the pandemic.

完整分析,发表于 科学揭示了该病毒在2020年初被引入英国的次数超过一千次,并且引入的速率和来源变化很快。在此期间,从西班牙(33%),法国(29%),然后是意大利(12%)引入了最大数量的传动链,而中国仅占进口的0.4%。该研究表明,英国国家封锁如何影响个人传播链。

牛津市动物学系和牛津马丁学校的通讯作者,共同首席作者奥利弗·皮布斯(Oliver Pybus)教授说:“这项研究表明,可以在时间和空间上准确地追踪各个病毒的传播谱系。每周进行一次分析意味着基因组追踪可以成为公共健康监测的关键组成部分。”

研究结果为英国第二波经济的发展提供了至关重要的背景,研究小组为识别在英国迅速发展的新变种(称为B.1.1.7)做出了贡献。科学家们说,将新变种的行为与第一波血统的行为进行详细的比较,对于理解为什么B.1.1.7现在如此迅速地传播至关重要。

Before the March 2020 lockdown, high travel volumes 和 few restrictions on international arrivals led to the establishment 和 co-circulation of >1000 identifiable UK 传播 血统s, jointly contributing to accelerated epidemic growth that quickly exceeded national contact tracing capacity.

Pybus教授说:“通过重构将COVID-19引入英国的时间和地点,我们可以发现,较早的旅行和隔离干预措施可能有助于降低英国第一波病例的发病率和强度。”

研究小组预计,在其他国家,类似的流行病流行和国际旅行量也将类似。

尽管英国国家封锁,进口量有限和地区减少 多样性,其对血统灭绝的影响取决于大小,这意味着最大和最广泛的血统一直持续到夏天。

SARS-CoV-2传播的过度分散性质可能有利于更大,更广泛的血统的生存,并在低流行地区更快地消除血统,这突显了快速或先发性干预措施在减少传播中的重要性。

当前正在研究尚存世系对英国2020年秋冬冬季流行的影响程度,包括特定突变对世系增长率的影响。

本研究中首次测量的传播结构和动力学提供了一个新的背景,在该背景下,应该计划和评估未来在区域,国家和国际范围内的公共卫生行动。

牛津市动物学系的首席研究员路易斯·杜·普莱西斯博士说:“我们的工作对单个流行病的发生提供了无与伦比的观点。英国每周都会公开分享大量的病毒遗传数据,如果您愿意,没有这种级别的监视,您将不知道病毒进化的真实情况,并且 。”

合著者,Verity Hill博士爱丁堡大学的研究人员说:“这种连续的,在全国范围内协调的基因组测序不仅使我们能够进行高分辨率的分析,而且还可以帮助其他国家将其基因组数据置于背景之中,并有助于全球的大流行应对。”

4月份决定资助英国的COVID-19 Genomics UK(COG-UK)财团,并在牛津大学领导的数十年来对病毒进化的蓝天基础研究的基础上,决定了大规模提高基因组监测的能力成为可能。爱丁堡大学和爱丁堡大学开发了该理论,从而使科学家可以使用这些工具和理论。



更多信息: 路易杜普莱西斯等。英国SARS-CoV-2流行病的建立和血统动态, 科学 (2021年)。 DOI:10.1126 / science.abf2946
期刊信息: 科学

Provided 通过 牛津大学
引文: 使用基因组流行病学准确追踪了英国的COVID-19传播链(2021年1月12日) 2021年1月24日检索 from //xasqxhb.com/news/2021-01-covid-transmission-chains-uk-accurately.html
本文件受版权保护。除了出于私下学习或研究目的进行的任何公平交易外, 未经书面许可,不得复制部分内容。内容仅供参考。

用户评论