2020年8月21日

基因组分析揭示了许多动物物种可能易受SARS-COV-2感染的影响

一种新的基因组研究将SARS-COV-2穗蛋白的潜力排名在410个脊椎动物中与ACE2受体部位结合的潜力。预计旧世界的灵长类动物和大猿,其在结合位点具有相同的氨基酸,以具有非常高的结合ACE2倾向,并且可能易于SARS-COV-2感染。信用:Matt Verdolivo / UC Davis

根据加利福尼亚大学戴维斯大学的一项新的研究,人类不是SARS-COV-2的唯一面临潜在威胁的潜在威胁,这些冠心病

国际科学家国际团队使用基因组分析来比较人生素转化酶-2中病毒的主要细胞受体,或艾塞2-in 410种不同种类的脊椎动物,包括鸟类,鱼类,两栖动物,爬行动物和哺乳动物。

Ace2通常在许多不同类型的细胞和组织上发现,包括鼻子,口腔和肺部的上皮细胞。在人类中,ACE2蛋白的25个氨基酸对于病毒是重要的,以结合和增益进入细胞。

研究人员使用ACE2蛋白的这些25个氨基酸序列,以及将预测的蛋白质结构与SARS-COV-2穗蛋白的建模,以评估在不同物种的ACE2蛋白中发现了多少这些氨基酸。

“符合人蛋白质匹配的所有25个氨基酸残基的动物被预测通过ACE2收缩SARS-COV-2的最高风险,”joana damas说,本文首次作者和UC戴维斯的博士后研究员工。 “预计风险将减少物种ACE2结合残留物的越多。”

大约40%可能易于SARS-COV-2的物种被国际植物联盟归类为“威胁”,以保护性质,可能尤其容易受到人对动物传播的影响。这项研究于8月21日公布 国家科学院的诉讼程序.

“数据提供了识别易受伤害和威胁的重要起点 威尔斯-CoV-2感染的风险,“哈里斯·莱灵,刘尔·刘林说,尊敬的教授,在UC戴维斯的演变和生态教授。”我们希望它激发了在大流行期间保护动物和人类健康的实践。“

濒危物种预计存在风险

几种批判性濒临灭绝的灵长类动物,如西部低地大猩猩,苏门答腊猩猩和北方白颊长臂猿,预计通过其ACE2受体对SARS-COV-2感染的风险非常高。

其他动物被标记为高风险包括海洋哺乳动物,如灰色鲸鱼和瓶装海豚,以及中国仓鼠。

发现猫,牛和绵羊等家畜有一种中等风险,并且发现狗,马匹和猪具有较低的ACE2结合风险。如何通过未来的研究确定涉及感染和疾病风险,但对于具有已知感染性数据的物种,相关性很高。

在貂皮,猫,狗,仓鼠,狮子和老虎中的SARS-COV-2感染病例中,病毒可能使用ACE2受体,或者它们可以使用除ACE2之外的受体以获得对宿主细胞的进入。较低的结合倾向可以转化为降低感染的倾向,或者在动物或动物之间传播的感染能力降低。

由于动物潜力从人类收缩新的冠状病毒,反之亦然,包括国家动物园和圣地亚哥动物园,这两者都有贡献的基因组材料,加强了保护两种动物和人类的计划。

“动物园和动物传播的人气和动物传播是对动物园和动物护理专业人员的新挑战,”史密森尼 - 梅森保护和前保护生物学家史密森学派高级研究科学家克劳斯-PeterKoepfli表示,史密森尼保护生物学研究所的物种生存中心和保护基因组学中心。 “这一新信息使我们能够将努力集中并相应地将动物和人类安全。”

作者迫使警告根据计算结果,谨慎对预测预测的动物风险,注意到实际风险只能通过额外的实验数据确认。列表 can be found here.

研究表明,SARS-COV-2的直接祖先可能起源于蝙蝠种类。发现蝙蝠通过其ACE2受体承包新型冠状病毒的风险非常低,这与实际的实验数据一致。

蝙蝠是否直接直接将新的冠状病毒直接传染给人类,或者是否通过中间宿主,尚不清楚,但研究支持一个或多个中间宿主所涉及的想法。数据允许研究人员归零 可能曾在野外担任中级主持人,协助努力控制人类和动物人群中未来爆发的SARS-COV-2感染。

更多信息: “通过脊椎动物中ACE2的比较和结构分析预测的SARS-COV-2广泛的宿主范围,” 国家科学院的诉讼程序 (2020)。 DOI:10.1073 / PNAS.2010146117 , www.pnas.org/content/early/2020/08/20/011117.

信息信息: 国家科学院的诉讼程序

Provided by UC戴维斯

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